3 - JUAN DE ALIAGA Y MEDRANO: Natural de los Reyes (Lima - 30/06/1539). Desde la edad de 10 años fué criado bajo la tutela de su tío carnal el Regidor D. Lorenzo de Aliaga y Ramírez, por el fallecimiento de su madre y la ausencia del Perú de su progenitor el Conquistador Aliaga, en ejercicio de la honrosa misión de Procurador de la Ciudad ante Carlos V. Ya en edad viril sirvió con el grado de Capitán de Número de la ciudad de los Reyes.
En 1584 recibió "conducta" de Capitán de Navío de la Real Armada, según título de 04/06/1584 y marchó a Panamá en la Armada de Nuestra Señora de Clarines, en ejercicio de importantes comisiones del Virreynato del Perú, con la dotación de 80 hombres, bajo su propio peculio y con un gasto de más de 6 mil pesos oro. En 1589 intervino en Lima en el recibimiento del Virrey García Hurtado de Mendoza, Marqués de Cañete. En esta ocasión ejerció mando sobre las fuerzas de infantería de Lima "quera mucha, costosa y bizarramente aderezada", luciendo regia indumentaria de "Leonada y plata". En la guardia y defensa del Virreinato erogó más de cuarenta mil pesos su propio patrimonio.
Al fallecimiento de su padre el Conquistador, sucedió en los repartimientos, materia de su Encomienda, situados en Recuay y Chancay, "por la circunstancia de ser hijo mayor precedente". La Encomienda de Recuay era una de las más importantes del Perú. En 1576 tenía más de 3400 indios tributarios y su sede principal era la población de Huaraz. La población indígena de esta Encomienda ascendió, en 1583, a 17103 personas reducidas en 6 pueblos denominados: Santiago de Pira, San Jerónimo de Quihoc, Santa Ana de Chuso, San Antonio de Padua, San Juan de Paradin y San Alfonso de Recuay, dentro de la jurisdicción del Corregimiento de Huaylas.
A su vez, la Encomienda sita en el Corregimiento de Chancay, estaba fundada sobre el pueblo de San Juan de Huaral con 370 personas registradas en 1583.En 1584 recibió "conducta" de Capitán de Navío de la Real Armada, según título de 04/06/1584 y marchó a Panamá en la Armada de Nuestra Señora de Clarines, en ejercicio de importantes comisiones del Virreynato del Perú, con la dotación de 80 hombres, bajo su propio peculio y con un gasto de más de 6 mil pesos oro. En 1589 intervino en Lima en el recibimiento del Virrey García Hurtado de Mendoza, Marqués de Cañete. En esta ocasión ejerció mando sobre las fuerzas de infantería de Lima "quera mucha, costosa y bizarramente aderezada", luciendo regia indumentaria de "Leonada y plata". En la guardia y defensa del Virreinato erogó más de cuarenta mil pesos su propio patrimonio.
Al fallecimiento de su padre el Conquistador, sucedió en los repartimientos, materia de su Encomienda, situados en Recuay y Chancay, "por la circunstancia de ser hijo mayor precedente". La Encomienda de Recuay era una de las más importantes del Perú. En 1576 tenía más de 3400 indios tributarios y su sede principal era la población de Huaraz. La población indígena de esta Encomienda ascendió, en 1583, a 17103 personas reducidas en 6 pueblos denominados: Santiago de Pira, San Jerónimo de Quihoc, Santa Ana de Chuso, San Antonio de Padua, San Juan de Paradin y San Alfonso de Recuay, dentro de la jurisdicción del Corregimiento de Huaylas.
Durante los años 1583-1593 sirvió D. Juan de Aliaga y Medrano el cargo de Secretario de la Real Cámara y Chancillería del Virreinato del Perú, después de reñida contienda judicial.
Contrajo matrimonio en los Reyes (Lima) con doña Francisca de Figueroa Sotomayor, hermana entera de doña Leonor de Figueroa, legítima mujer del primer Mayorazgo de la Casa de Aliaga. Debió fallecer por el año 1610. Su mujer fué sepultada el 13/11/1592 en la cripta de la Iglesia Santa Rosa de Lima.
HIJOS:
- Doña María de Figueroa Sotomayor (las mujeres usaban el apellido de la madre. Casada en Lima en 1576 con D. Juan Alvarez Sotomayor - Regidor, Alcalde y Procurador en la época del Virrey Toledo; y fundador entre otros de la Iglesia de Santo Domingo-. La ceremonia fue apadrinada por Don Francisco de Toledo, Virrey de Perú. Sepultada en 1608 en la cripta funeraria de la Iglesia de Santo Domingo de Lima.)
- Don Bernardino de Aliaga y Figueroa (Importante minero de Huancavelica desde 1590. Falleció soltero en 1626 en la ciudad de Chuquisaca)
- Don Jerónimo de Aliaga y Figueroa.